生物工程系设有生物制药、食品生物技术及食品深加工两个专业，具有生物化工硕士学位、博士学位授予权，承担化工学院本科、硕士及博士的专业课程教学，主要研究方向有生物医药及其剂型加工与应用、食品生物技术产品开发及应用、生物农药及其剂型加工与应用、生物肥料开发与应用、生物质表面活性剂开发及应用等。
机构内岗位及人员：

主  任： 郝晓亮（副教授，博士，硕士生导师）

支部书记：魏伯峰（讲师，博士）

教师：张  伟 （副教授，博士，硕士生导师）

教师： 王  勇（教授，博士，博士生导师）

教师： 徐英黔（副教授，博士，硕士生导师）

教师： 姜忠良 （副教授，博士，硕士生导师）

教师：张 丽（讲师，博士）

教师：张程（讲师，博士）

教师：孟凡池（讲师，博士）